lncRNA测序

简介

LncRNA 指长度≥200nt 的非编码 RNA。哺乳动物基因组序列中约 5%-10%被稳定转录,其中蛋白质编码基因仅约占 1%,其余 4%-9%的序列都转录为ncRNA。近年来的研究表明,LncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,该研究已成为遗传研究热点。LncRNA的研究作为RNA研究的新领域,在生产、生活、健康方面具有重要意义,可通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达,在生产上对物种的改良,在人类健康方面参与疾病相关的信号通路从而对疾病的发生发展及治疗有重要作用。

lncRNA的研究策略

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我们的优势

  • 爱默生物为您提供全面的lncRNA研究方案。从样本制备、建库测序、生物信息学分析到后期数据解读,通过一站式的专业服务,让您更好地专注于科学研究。
  • 成熟、稳定的实验流程保障实验结果的可重复性;
  • 强大的超级计算平台搭配经验丰富的的生信分析专家团队;

技术路线

  • 总RNA提取(RNA样品≥3μg)
  • RNA质检
  • 去除rRNA法链特异性文库构建
  • 上机测序
  • 数据分析

生信分析

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服务周期

60天

案例分析

[1]研究人员发现,长非编码RNA Uc.283+A控制着Pri-miRNA的加工,Pri-miRNA是microRNA基因的初级转录产物。这种lncRNA也被称为超保守RNA(ultra-conserved RNA),因为它的序列在进化中高度保守,从鸡到人没有出现任何变化。研究显示,超保守RNA就像磁铁一样附着在另一种非编码RNA上,控制着它们的功能。这些超保守RNA就像是健康细胞中的高级督察,对调控者microRNA实施监管。如果细胞缺乏超保守RNA,microRNA就会受到影响,进而改变数以百计的基因表达,最终导致人体长出肿瘤。

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[2] 在2013年《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中,来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang,音译)等研究人员揭示,两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。雄激素受体是一种可响应雄激素激活成千上万基因表达的转录因子。作者们发现抑制这两种lncRNAs可以阻止由于雄激素受体突变导致抵抗激素疗法的前列腺癌细胞的生长。研究发现两种lncRNAs:PRNCR1和PCGEM1在许多侵袭性前列腺癌中高水平表达,增强了雄激素受体相关转录程序,促进了癌症生长。

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图2 AR和前列腺特异性lncRNAs信号间的相关作用

参考文献

[1] Julia L, Anna P, etc. Regulation of pri-miRNA Processing by a Long Noncoding RNA Transcribed from an Ultraconserved Region.

[2]Yang L, Lin C,etc. lncRNA-dependent mechanisms of ndrogen-receptor-regulated gene activation programs. Nature. 2013 Aug 29;500(7464):598-602.